对食物过敏的宝宝，首先要回避引起过敏的食物，比如对牛奶蛋白过敏的宝宝，要严格避免食用牛奶蛋白及含牛奶成份的食物。
对0-1岁牛奶蛋白过敏的宝宝，必须选择一个可替代牛奶的配方营养粉。市面上的豆蛋白配方粉，羊奶配方粉等都不是用于牛奶蛋白过敏宝宝的最佳饮食替代，因为无论是豆蛋白配方还是羊奶配方，其中都含有完整的蛋白质，对牛奶蛋白过敏的宝宝相当一部分也会对豆蛋白、羊奶蛋白过敏。
目前医学界的公认推荐是：如果宝宝对牛奶蛋白过敏，如果无法母乳喂养，应选择完全水解牛奶蛋白配方。绝大多数宝宝在接受完全水解蛋白配方后两周内症状缓解或消失。如果宝宝在使用完全水解蛋白配方症状仍无缓解的，这时应使用氨基酸配方粉。
一般来说，通过饮食调整，回避过敏食物，宝宝的过敏症状即可得到缓解，不会影响生长发育。但也有少数重度食物过敏宝宝需要在医生的指导下采取药物治疗。
随着年龄的增长，宝宝的免疫系统也在逐渐成熟。在宝宝过敏症状完全消失3-6个月后，可逐渐从氨基酸配方过渡为完全水解配方，再从完全水解配方过渡到适度水解配方，从而帮助宝宝过渡到正常饮食。
