牙根是深深地埋藏在颌骨里的，颌骨外面还有牙龈保护，一般情况下，口腔中的细菌是不会引起牙根发炎的。
如果口腔中的细菌与牙冠接触，在牙冠上沉积起来，并且生长繁殖，形成牙菌斑。它附着在牙冠上并引起牙齿脱钙，渐渐形成龋洞。龋洞里的细菌很多，细菌的感染和破坏很快使龋洞加大加深，直至影响牙髓。牙髓一旦接触到细菌必然会感染发炎，渐渐死去，最终导致牙根发炎了。此外，导致牙根发炎的原因还有两个：
① 牙齿外伤： 外伤时， 如果牙冠折断了， 牙髓就暴露出来了， 得不到及时治疗就会导致牙根发炎。
②化学性损伤：使用化学性药物如砷类制剂处理牙髓时，处理不当，就会损伤牙根组织。牙科使用砷剂的目的是破坏发炎的牙髓组织。砷有剧毒，只要一点点砷剂就可使牙髓破坏。
砷剂如果用量过大或使用时间过长，便会损伤牙根组织。砷剂虽使用时间，就不会破坏牙根组织。因此牙科医生反复告诉病人一定要按时复诊。某些患者，由于不知道砷剂的这种危害性，或是因为没时间， 超过了约定的复诊时间， 结果导致砷剂将牙根组织损伤，这种牙根病变被称为化学性根尖周炎。
